短串联重复序列(short tandem repeat,STR)是广泛存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的DNA序列,核心单位为2~6个碱基,按孟德尔规律呈共显性遗传。由于核心单位及其重复次数不同,STR在不同种族、不同人群、不同个体之间的分布具有很大的差异性,构成了STR的遗传多态性。在人类基因组中,平均每15~20 kb就存在一个STR位点,人类23对染色体上分布着近8000多个STR位点[1]。
由于其广泛性和多态性,STR位点可作为特异性高、灵敏度强的遗传标记。结合PCR技术,STR检测已经广泛应用于遗传制图、基因定位、法医学鉴定、产前诊断等许多领域。
STR检测技术原理
定量荧光PCR(quantitative fluorescence PCR,QF-PCR)是检测STR位点最常用的技术手段之一,一般选择多个多态性高的STR位点,根据基因组中的目标STR位点设计荧光标记引物,待测DNA样本通过荧光标记引物进行PCR扩增。由于STR重复数不同,同一STR位点的扩增产物长度存在差异,再加上荧光信号的强度与扩增产物的拷贝数成正比,通过毛细管电泳仪分析扩增产物荧光信号的数量和强度,即可实现对原始模板的定量和等位基因的定性。
STR检测技术流程
STR检测在产前诊断中的应用
单亲二体疾病辅助诊断
单亲二体(uniparental disomy,UPD)疾病是指由两条同源染色体均遗传自一个亲代引起的疾病。UPD可分为单亲同二体(isodisomy,来自同一亲体的同一染色体)和单亲异二体(heterodisomy,分别来自同一亲体的两条同源染色体),可以是染色体上的某一片段,也可以是一整条染色体。在目标染色体/区域内选择多个多态性高的STR位点,根据这些位点的杂合度情况,判断目标染色体/区域是否纯合,进而反映是否发生了UPD。不过单样品的STR检测仅能反映单亲同二体,一般用于特定染色体/区域的验证,不适宜用于全基因组范围内的UPD疾病筛查。
母源细胞污染排查
母源细胞污染(maternal cell contamination,MCC)在介入性产前诊断过程中时有发生,严重影响诊断结果。对羊水、产前绒毛、脐带血、流产组织等样本的DNA进行STR检测,可判断样本的胎源性,高效排查MCC的发生。目前,《低深度全基因组测序技术应用于产前诊断中的专家共识》明确建议,可使用STR检测对产前样本进行MCC判断[2]。
常见染色体非整倍体疾病快速产前诊断
当所选STR位点集中于非整倍性高发的染色体(21/18/13/X/Y)时,即可通过扩增产物荧光信号的数量和强度实现对原始模板的定量,为21三体、18三体、13三体和XXY、XYY及XXX等常见非整倍体综合征提供辅助判断。
参考文献:
1. 马威, 张亮, 李岩, 徐飞. 人类短串联重复序列(STR)及其研究进展[J]. 大连医科大学学报, 2007, 29(1):78-81.
2. 中华医学会医学遗传学分会临床遗传学组, 中国医师协会医学遗传医师分会遗传病产前诊断专业委员会, 中华预防医学会出生缺陷预防与控制专业委员会遗传病防控学组. 低深度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识[J]. 中华医学遗传学杂志, 2019, 36(4):293-296.
对于怀孕阶段的准妈妈来说,按时进行各种孕期检查是保证母胎健康的重要手段。在整个孕期中有多项检测,介入性产前诊断是其中比较特殊的一项。在临床中,介入性产前诊断是胎儿染色体检查和单基因遗传病诊断的主要方法,其操作流程为:在超声波的引导下经孕妇腹部对胎儿相关样本(绒毛、羊水、脐血)进行提取,然后进行细胞培养、分子遗传学或生化遗传学检查,最后进行染色体诊断或基因诊断。
目前,常见的介入性产前诊断技术包括羊膜腔穿刺、绒毛穿刺、经皮脐血穿刺等。由于这些穿刺过程不可避免的经过母体,存在母源细胞污染(maternal cell contamination,MCC)的风险,再加上后续染色体检查和基因诊断存在基因扩增,这使得微量的母体组织污染都可能严重干扰诊断结果,造成严重的临床后果。
MCC普遍存在
MCC干扰结果判定
因此,鉴定所取胎儿组织是否存在MCC是产前诊断分子遗传实验室必需具备的鉴别技术。临床中,MCC的排查方法经历了以下几个阶段:
01 Kleihaure抗酸染色法
该方法是鉴别母血与胎血的传统技术,技术原理是胎儿血红蛋白比成人血红蛋白更能抵抗酸变性[5]。Kleihaure抗酸染色法广泛应用于母婴溶血、妊娠期间外伤及阴道出血等临床检测,具有操作简单、成本低廉等优点。然而,如果母体血液中胚胎血红蛋白含量异常升高,如镰状细胞病或部分β地中海贫血病,染色过程中就会出现将母血误鉴为胎儿血的错误结果。在18例用Kleihaure抗酸染色技术鉴定实验中,至少有2例将母血错误地鉴定为胎儿血[6]。
02 流式细胞术
该技术于70年代初发展起来,其工作原理是采用激光作为激发光源,利用荧光染料与单克隆抗体技术标记母源或胎源细胞,结合计算机系统对流动的单细胞悬液中单个细胞的多个参数信号进行数据处理分析,以此对细胞进行区分。相比Kleihaure抗酸染色法,流式细胞术具备快速、灵敏和特异的特点,但也存在仪器价格昂贵、操作繁琐等弊端[7]。
03 短串联重复序列
短串联重复序列(short tandem repeat,STR)是人类基因组DNA中广泛存在的一类具有高度多态性和遗传稳定性的遗传标序列,核心序列为2-6个碱基,经过几次到几十次串联重复,构成特定的DNA片段遗传标记。个体同一等位基因上这种序列重复次数不同,呈多态性并按孟德尔规律呈共显性遗传,因此选取几个STR位点可作为一有效个体识别标志,具有极强的特异性[8]。结合PCR技术,使得此技术具有极强的灵敏度。选取具有高杂合度和高多态性的STR位点,应用多重PCR对羊水、脐血等进行母血污染鉴定,具有极强的灵敏度,结果准确可靠[9]。目前,《低深度全基因组测序技术应用于产前诊断中的专家共识》明确建议,可使用STR检测对产前样本进行MCC判断[10]。
随着分子时代的到来,STR检测的优势愈发突出,该技术准确、便捷、快速、低价,适宜在各级医院及实验室进行推广,具有广阔的应用前景。尤其在产前诊断方面,STR检测可用于MCC排查、单亲二体疾病辅助诊断、非整倍性染色体疾病快速诊断等,其临床价值受到临床医生越来越多的肯定。
参考文献:
1. Winsor EJ, Silver MP, Theve R, Wright M, Ward BE. Maternal cell contamination in uncultured amniotic fluid. Prenat Diagn. 1996 Jan;16(1):49-54. doi: 10.1002/(SICI)1097-0223(199601)16:1<49::aid-pd808>3.0.CO;2-U. PMID: 8821852.
2. Van Opstal D, Boter M, de Jong D, van den Berg C, Brüggenwirth HT, Wildschut HI, de Klein A, Galjaard RJ. Rapid aneuploidy detection with multiplex ligation-dependent probe amplification: a prospective study of 4000 amniotic fluid samples. Eur J Hum Genet. 2009 Jan;17(1):112-21.
3. Wang Y , Li Y , Chen Y , et al. Systematic analysis of copy‐number variations associated with early pregnancy loss[J]. Ultrasound in Obstetrics & Gynecology, 2020, 55(1))。
4. Stojilkovic-Mikic T, Mann K, Docherty Z, Mackie Ogilvie C. Maternal cell contamination of prenatal samples assessed by QF-PCR genotyping. Prenat Diagn. 2005 Jan;25(1):79-83. doi: 10.1002/pd.1089. PMID: 15662689.
5. Martel-Petit V , Petit C , Marchand M , et al. Use of the Kleihauer test to detect fetal erythroblasts in the maternal circulation[J]. Prenatal Diagnosis, 2001.
6. Holcomb W L , Gunderson E , Petrie R H . Clinical use of the Kleihauer-Betke test[J]. Journal of Perinatal Medicine, 1990, 18(5):331-337.
7. Fernandes B J , Dadelszen P V , Fazal I , et al. Flow cytometric assessment of feto-maternal hemorrhage; a comparison with Betke-Kleihauer[J]. Prenatal Diagnosis, 2010, 27(7):641-643.
8. Edwards A I , Civitello A A , Hammond H A , et al. DNA Typing and Genetic Mapping with Trimeric and Tetrameric Tandem Repeats[J]. The American Journal of Human Genetics, 1991, 49(4):746-756.
9. 张清健, 方俊宇, 朱志勇,等. 短串联重复序列连锁分析进行产前诊断前母血污染鉴定的研究[J]. 中国实验诊断学, 2015, 000(005):728-731.
10. 中华医学会医学遗传学分会临床遗传学组, 中国医师协会医学遗传医师分会遗传病产前诊断专业委员会, 中华预防医学会出生缺陷预防与控制专业委员会遗传病防控学组. 低深度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识[J]. 中华医学遗传学杂志, 2019, 36(4):293-296.
检测血液中的CTC、cfDNA、ctDNA或外泌体等检测方法,称之为液体活检。相比于传统的检测方法,液体活检具有副作用小、操作简单、能重复取样等特点,能够解决临床取样的难题,满足对患者高频检测的需求。与组织或穿刺活检比较,成本更低。
卵巢癌是女性生殖系统常见的恶性肿瘤之一,发病率为女性生殖系统恶性肿瘤第三位,死亡率高居首位,主要包括卵巢上皮癌、卵巢恶性生殖细胞肿瘤和恶性性索间质肿瘤等。我国卵巢癌发病率存在地区差异,主要表现为城市高、农村低,城市发病率为6.310万~9.210万,而农村仅为2.210万。
PGS(preimplantation genetic screening),即胚胎植入前遗传学筛查,是指在进行辅助生殖技术(IVF/ICSI)助孕的过程中,在胚胎移植之前,对早期胚胎或者卵子散在发生的染色体异常进行筛查,以挑选染色体正常的胚胎植入子宫,以期减少因胚胎染色体异常导致的流产及反复流产,获得正常的妊娠,提高IVF妊娠率。
PGD(preimplantation genetic diagnosis),即胚胎植入前遗传学诊断,是帮助夫妻双方或一方携带遗传病致病基因进行优生的一项辅助生殖技术。它是指在夫妇已经确诊患有某种已知遗传疾病(包括染色体疾病、单基因遗传病等)或携带其致病突变的情况下,对夫妇的胚胎进行植入前诊断,可以选择受家族遗传病影响最小的胚胎植入,从而避免遗传病患儿出生,降低单基因疾病导致的出生缺陷率。
人类胚胎存在较高比例的染色体异常,尤其是高龄妇女和反复流产的夫妇。胚胎染色体异常是导致胚胎着床失败、早孕期胎儿流产的一大因素。研究表明,随着年龄的增长,女性产生的正常卵子数量下降,导致胚胎中染色体数目异常的胚胎比例增加。
PGS检测可以在胚胎植入母体之前,筛选出检测结果为染色体正常的胚胎进行植入,从而减少因胎儿染色体问题而带来的流产甚至引产,减少移植次数,提高治疗效率。
(1)促排卵治疗
由于不是每个卵子都能受精,不是每个受精卵都能发育成有活力的胚胎,因此要从女性体内获得多个卵子,才能保证有可以移植的胚胎,这就需要对女性进行促排卵治疗。
促排卵的方案有很多种,如标准长方案、短方案、拮抗剂方案等,需根据每个人的具体情况来制定。
(2)取卵
医生在B超引导下应用特殊的取卵针经阴道穿刺成熟的卵泡,吸出卵子。
(3)体外受精
当女性取卵时,男性进行取精。精液经过特殊的洗涤过程后,将精卵放在特殊的培养基中,自然结合。
(4)胚胎移植
受精后数日,应用一个很细的胚胎移植管,通过子宫颈将最好的胚胎移入母体子宫,根据年龄、胚胎质量和既往IVF的结局,决定移植胚胎的个数,通常移植2-3个胚胎。近年来,为了降低多胎妊娠率,一些中心选择单胚胎移植,或最多移植2个胚胎。
(5)黄体支持
妇女在取卵周期通常存在黄体功能不足,需要应用黄体酮和/或绒毛膜促性腺激素进行黄体补充/支持。
(6)妊娠的确定
胚胎移植后14天测定血清HCG,确定是否妊娠。胚胎移植后21天再次测定血清HCG,以了解胚胎发育的情况。胚胎移植后30天经阴道超声检查,确定是否宫内妊娠,有无胎心搏动。
(1)注意休息
试管婴儿移植后要注意休息,这对试管婴儿的成败起着一定的作用,所以患者要在医师的指导下,合理休息。
(2)适当运动
试管婴儿移植后是需要卧床休息48小时的,但是过了一段休息时间后,也需要进行合适的运动,但要避免用力运动、慢跑以及骑自行车等。
(3)饮食方面
选择易消化饮食;多吃富含高纤维的蔬菜、水果,少食用辛辣食物;禁吃易引起过敏的食物;给予高蛋白、易消化饮食,少量多餐,适量控制盐的摄入。
(4)保持良好心态
患者在移植后要放平心态,抱有一颗平常心。
(5)避免不良习惯
移植后,患者要养成良好的习惯,避免烟酒,避免接触有辐射的物质,这对试管婴儿移植成功是非常有帮助的。
女方检查项目:
(1)传染性疾病抽血检查。其中包括了血常规、血型、乙肝、丙肝病毒免疫学、梅毒螺旋体抗体、人类免疫缺陷病毒抗体、凝血功能、肝肾功能等;
(2)阴道分泌物支原体、衣原体、淋球菌培养,脱落细胞检查;
(3)内分泌测定,女方患者在月经第3-5天完成检查;
(4)B超检查,这需要女方患者在月经第10-12天进行;
(5)必要时外周血染色体核型检查;
(6)心电图、尿常规检查。
男方检查项目:
(1)抽血检查,在移植前需要男方进行血型、乙肝、丙肝病毒免疫学、梅毒螺旋体抗体、人类免疫缺陷病毒抗体测定;
(2)精液常规及精子形态学检查,包括精液支原体、衣原体、淋球菌培养;
(3)必要时需检查外周血染色体核型检查。
由于移植多个胚胎到子宫,因此IVF技术导致的多胎妊娠率显著高于自然妊娠,约为 25-30% 左右。多胎妊娠晚期流产和早产的风险显著高于单胎妊娠,母亲患妊娠期糖尿病、妊娠期高血压病、发生难产和产后出血的风险显著增加。
因此,多胎妊娠对母婴都不利。目前许多IVF中心为降低多胎妊娠率,开始减少移植胚胎数,或进行单胚胎移植。对于三胎或三胎以上妊娠者,必须进行减胎,而对于双胎妊娠者,建议患者减胎。
NIPT是Non-invasive Prenatal Testing的简称,即无创产前DNA检测。无创产前DNA检测是针对胎儿染色体数目异常疾病的检测技术,目前发病率较高的21-三体综合征(唐氏综合征)、18-三体综合征(爱德华氏综合征)和13-三体综合征(帕陶氏综合征)都在其检测范围内。该方法采用新一代高通量测序技术结合生物信息学分析方法,对孕妇外周血中的胎儿游离DNA进行检测和分析,是一项比较安全、准确率高、快捷的检测技术。
白血病就是通常说的“血癌”,是造血系统常见的恶性肿瘤。表现为正常血细胞生成减少,周围白细胞发生质和量的异常,白细胞及其幼稚细胞(即白血病细胞)在骨髓或其它造血组织中进行性、失控制的异常增生,进而浸润并损害各种组织,产生不同症状。
家族史可以提示乳腺癌的遗传风险。如果家族中有成员符合以下任何一种情况,则提示该家族可能具有乳腺癌高风险,建议该家族的乳腺癌患者或高危个体接受BRCA1/2基因检测:
1. 家族中有发病年龄≤45岁的乳腺癌患者;
2. 家族中有男性乳腺癌患者;
3. 家族中除有一名乳腺癌患者外,还有1个或1个以上具血缘关系的近亲患乳腺癌;
4. 家族中有卵巢癌、输卵管癌、原发性腹膜癌既往病史或家族史的乳腺癌患者;
5. 家族中有双侧原发性的乳腺癌患者
6. 家族中有携带BRCA1/2基因突变的家属
肿瘤领域液体活检主要包括CTC和ctDNA检测。
1) 循环肿瘤细胞(circulating tumor cells, CTCs)是指自发或因诊疗操作由实体瘤或转移灶释放进入外周血的循环肿瘤细胞,是恶性肿瘤患者出现术后复发和远处转移的重要原因,也是导致肿瘤患者死亡的重要因素。
2)循环肿瘤DNA(ctDNA,Circulating Tumor DNA)是人体血液系统中带有的来自肿瘤基因组的DNA片段。这些肿瘤DNA往往含有肿瘤基因组所特有的基因突变,因此也可以用于患者肿瘤动态及治疗效果的评估,有助于医生制订医疗方案。
什么是染色体?什么是染色体异常?
染色体是组成细胞核的基本物质,是基因的载体。人类体细胞有23对染色体,其中22对为男女所共有,称为常染色体;另外一对为决定性别的染色体,男女不同,称为性染色体;男性为XY,女性为XX。
人类染色体核型图
体细胞或性细胞内染色体发生异常改变称为染色体异常,可分为数目异常和结构异常两大类。染色体异常可以自发地产生,称为自发突变;也可以通过物理的、化学的和生物的诱变作用而产生;还可以由亲代遗传所致。
目前卵巢癌的发病原因尚不清楚,比较明确的是肿瘤家族史是卵巢癌的一项重要危险因素,尤其是卵巢癌和乳腺癌的家族史。遗传相关的卵巢癌约占全部卵巢癌10%以上,多数呈家族聚集性,其中遗传性乳腺癌卵巢癌综合征(HBOC)最为常见,在HBOC患者中,BRCA1和BRCA2总的突变率为40-50%,BRCA1和BRCA2突变携带者在一生中发生卵巢癌的风险分别达54%和23%,是发生卵巢癌的高危个体。
NIPT对染色体数目异常的T21、T18和T13染色体进行检测,检测准确率高达99%以上。
(1)一代试管婴儿技术——常规体外受精和胚胎移植技术;
(2)二代试管婴儿技术——卵胞浆内单精子注射技术;
(3)三代试管婴儿技术——植入前胚胎遗传学诊断技术。
根据白血病的病程及细胞形态学可将白血病分为:
(1)急性白血病 细胞分化停滞在早期阶段,病情发展迅速,骨髓及周围血中主要是异常原始和幼稚细胞。其自然病程多在6个月以内。急性白血病又分:A、急性淋巴细胞白血病(ALL);B、急性非淋巴细胞白血病(AML)。
(2)慢性白血病 病程较长,骨髓及血中主要是较成熟的异常细胞,其次为幼稚细胞。自然病程多在一年以上。慢性白血病主要包括:慢性粒细胞白血病(CML);慢性淋巴细胞白血病(CLL)。
(3)特殊类型白血病 如低增生性白血病、绿色瘤或粒细胞肉瘤、嗜酸粒细胞白血病、嗜碱粒细胞白血病等。
BRCA1/2基因为BRCA1和BRCA2基因的合称。BRCA1和BRCA2都是人类基因组中负责产生肿瘤抑制蛋白的基因,分别位于17号和13号染色体,正常的BRCA1/2基因能够修复细胞中受损DNA,维护细胞中基因组稳定的作用。如果BRCA1/2基因的特定位点发生突变,其产生的肿瘤抑制蛋白会随之发生改变,正常修复DNA功能会受到限制,细胞更容易积累有害的DNA损伤,从而增高乳腺癌的风险。
1) 取样方便,只需抽取血液即可完成对肿瘤细胞DNA的分析与解读,避免穿刺、手术等有创方式采集肿瘤组织的风险;可实时多次,彻底解决临床取样难的问题;
2) 无创无损,可实现对患者的早期诊断及高频监测,是一种理想的肿瘤标志物;
3)检测技术成熟,灵敏度高、准确度高、假阳性率低;利用NGS检测ctDNA,灵敏准确,可检测到低至0. 1%的低频突变;
4)应用范围广,几乎所有肿瘤细胞都可以将DNA片段释放到血液中。
手术联合化疗的综合治疗是卵巢癌患者的标准治疗。手术的目的在于明确分期,切除肿瘤或尽可能降低机体的肿瘤负荷,为后续化疗奠定基础。化疗的目的主要在于通过细胞毒药物的全身应用,杀灭残存及潜在的肿瘤细胞,降低复发的风险。两者联合应用显著延长卵巢癌患者的生存时间,改善生活质量。
染色体是组成细胞核的基本物质,是遗传物质基因的载体。在细胞复制过程中如果染色体不能正确分离或是出现断裂以及再次连接,就会导致染色体异常。染色体异常一般可以分为结构异常或数目异常。染色体结构异常主要是由于染色体的断裂和错误连接所引起的。染色体结构异常主要包括缺失、重复、易位、倒位、等臂染色体等类型。
染色体数目或结构异常所致的疾病被称为染色体疾病。染色体疾病会影响机体的多个方面,其中最主要与自然流产、不育不孕、微缺失、微重复综合征等具有较高的相关性。
唐氏筛查,是一种通过抽取血清,检测母体血清中甲型蛋白、绒毛和游离雌三醇的浓度,并结合孕妇的预产期、体重、年龄和采血时的孕周等,计算生出先天缺陷胎儿的危险系数的检测方法。
单精子卵胞浆内注射(Intracytoplasmic sperm injection, ICSI)是伴随IVF的一种特殊的受精方式,是把单个精子直接注入到卵细胞中,协助受精的一种技术,英文缩写为ICSI。
该技术适用于:
(1)需要经睾丸或附睾取精者、男性重度少弱精者通常需采用ICSI进行受精;
(2)既往IVF常规受精失败者可能需要通过ICSI受精;
(3)对于一些不明原因不孕不育的夫妇也可以考虑采用ICSI的方式进行受精;
(4)既往有异常受精,如多精受精历史者。
在我国,白血病发病率约为2.76/10万人,在恶性肿瘤死亡率中,居第6位(男性)和第8位(女性),而在儿童及35岁以下成人中其死亡率则居第一位;此外,急性型多于慢性型,急性白血病约占70%以上。
90%的恶性肿瘤早期无明显症状,一经发现通常已是中晚期,因此早发现、早预防、早治疗是防止癌症发生、减缓癌症发展的重要手段。
恶性肿瘤的发生与发展是遗传因素和环境因素等共同作用的结果,并与特定的基因突变相关,这些突变或是导致DNA的修复不能正常进行,或是导致基因抑制肿瘤发生的作用降低。因此通过基因检测,有助于从源头上评估受检者罹患肿瘤的风险,在个体患病前实施有效的监测、预警和干预,降低癌症发病风险。
中国普通女性到70岁时,乳腺癌的累积风险约为3%。而携带BRCA1/2基因突变的女性,到70岁时,乳腺癌的累积风险可达70%以上。
在散发性卵巢癌患者中,BRCA1/2基因突变的比例在10%以上,具有高危家族史的卵巢癌患者的BRCA12基因突变比例大于40%。对卵巢癌患者筛查BRCA1/2基因,可以有助于鉴别卵巢癌遗传风险高的人群,并且能够帮助这些人群和其亲属提前制定预防策略。在女性卵巢癌患者中,BRCA1/2基因检测也有助于鉴别出从PARP抑制剂(如奥拉帕尼)靶向治疗中获益的卵巢癌患者。
无创产前DNA检测,仅检测胎儿T21、T18、T13;NGS染色体异常检测应用领域与范围广于无创产前DNA检测,不仅应用于产前检测,也可应用于流产原因查找、染色体疾病检测、不孕不育病因排查等各方面,NGS染色体异常检测可检测大于100Kb的CNV及全部染色体非整倍体,在产前检测方面,NGS染色体异常检测为有创取样,样品为绒毛、羊水、外周血等。
早唐筛查的时间建议是7-13w,中唐筛查的时间建议是14-20w。
植入前胚胎遗传学诊断(Preimplantation Genetic Diagnosis, PGD)是在胚胎着床前对配子或胚胎的遗传物质进行分析,检测配子或胚胎是否有遗传物质异常的一种早期诊断方法;并通过PGD,选择检测正常的胚胎进行移植。
该技术适用于:
(1)性连锁遗传病;
(2)单基因相关遗传病;
(3)染色体病:
(4)染色体数目和结构异常;
(5)可能生育异常患儿的高风险人群。
近年来肿瘤研究表明,与细胞的生长和分化有关的基因在肿瘤发生过程中起关键作用,这些基因称为肿瘤相关基因。肿瘤是属于基因病的范畴,它的发生是遗传基因和环境因素共同作用的结果,其中遗传基因是内因,与人体是否具有肿瘤易感基因相关。现今已知至少有200余种单基因决定的性状或疾病具有不同程度的易患肿瘤倾向。
这是大家非常关注的,也是患者及家属常问的问题之一,白血病发病是多基因、多步骤、多阶段的复杂生物学现象,绝大多数白血病是基因与环境因素共同作用的结果,其中环境因素包括病毒感染、电离辐射、化学因素三种;而染色体易位后所形成的融合基因与白血病易感性有密切关系;此外,年龄、性别、神经免疫失调等也有可能引发白血病。
适用人群:
(1)有家族性肿瘤遗传病史的个体;
(2)有相关慢性病史的个体;
(3)有肿瘤相关高危因素影响的个体。
可选用人群:
对个人健康有深层次了解与高品质追求的个体。
本检测对受检者的BRCA1/2基因进行外显子检测,检测准确性可以达到99%以上。
受检者同意接受检测后,需填写送检单和知情同意书,随后由医务人员采集受检者的外周静脉血,所需血液量为5ml,7-10个自然日即可拿到检测结果。采血前无需空腹,保持正常饮食作息即可。需要注意的是,如果受检者有造血干细胞移植史或者三个月内有输血史,将导致外周血的基因检测结果不准确,固不推荐送检。
1)取样方便:无创无损、实时多次、易获取。
ctDNA检测只需抽取血液即可完成对肿瘤细胞DNA的分析与解读,避免穿刺、手术等有创方式采集肿瘤组织的风险。ctDNA检测可以实现实时、多阶段个体化诊疗服务。
2)检测技术成熟:灵敏度高、准确度高、假阳性率低。
利用NGS检测ctDNA,灵敏准确,可检测到低至0. 1%的低频突变。ctDNA携带肿瘤患者的基因信息,定量或定性分析这些循环DNA对肿瘤的早期诊断、治疗、病情监测及预后的评价具有重要的临床价值。ctDNA检测能够为肿瘤个体化治疗呈现较全面的分子生物学特性,是一种理想的肿瘤标志物。
3)检测应用范围广。
几乎所有肿瘤细胞都可以将DNA片段释放到血液中,因此,ctDNA能够体现患者体内肿瘤的综合情况。
根据2017版的NCCN指南,携带BRCA1/2基因突变患者的健康家属应对自身基因突变情况进行排查,如自身为非携带者,则风险与普通人群相似,依据普通人群筛查措施即可。如自身同为携带者,可依据如下措施预防和筛查卵巢癌,包括:
1. 对于已完成生育,年龄在35-40岁之间的女性,可以考虑预防性双侧输卵管-卵巢切除术;
2. 对于未接受双侧输卵管-卵巢切除术者而言,从30-35岁开始可以考虑每年接受CA-125和阴道超声的筛查。
NGS染色体异常检测的应用领域有哪些?
产前检测:排查孕期胎儿染色体异常,科学指导本次妊娠;
流产组织检测:分析自然流产、异常妊娠的原因,指导再次生育;
未成年人/成人检测:为不良孕产史、不孕不育、表型异常等查找遗传学原因。
NGS染色体异常检测的检测范围?
1、全部23对染色体的数目异常;
2、0.1M以上染色体缺失/重复以及大于10%的非整倍体嵌合;
3、不能检测染色体平衡易位、罗氏易位、倒位,单基因病、多基因病,以及D/G组染色体短臂等。
相关文献报道在第四周左右母亲的外周血中便存在着胎儿的游离DNA(cffDNA),且在8周后含量上升并稳定存在,因此可以通过检测母亲外周血中cfDNA相关信息进而对胎儿染色体异常情况进行判断。
IVF-ET技术治疗成功率一般用临床妊娠率进行判定,即临床妊娠周期占胚胎移植周期的比例,而临床妊娠是指胚胎移植后28-30天阴道超声观察到宫腔内妊娠囊。不同的IVF中心成功率有差异,多数中心每移植周期的成功率可达30-50%,部分中心报道每移植周期的成功率为60%-70%,临床治疗成功率受多种因素的影响,如患者的选择、临床治疗方法、实验室技术等。
儿童及青少年急性白血病多起病急骤。常见的首发症状包括发热、进行性贫血、显著的出血倾向或骨关节疼痛等。起病缓慢者以老年及部分青年病人居多,病情逐渐进展。此外,少数患者可以抽搐、失明、牙痛、牙龈肿胀、心包积液、双下肢截瘫等为首发症状。
基因检测的结果包括:
未检测到有害/疑似有害基因突变:表明受检者未携带BRCA1/2基因突变,乳腺癌遗传的可能性较小,该家族成员参考指南中一般人群妇女乳腺癌筛查办法即可;如果受检者有明显的乳腺癌家族病史,可推荐受检者接受更多遗传性乳腺癌相关基因检测。
检测到有害/疑似有害基因突变:表明受检者家族的乳腺癌风险较高,建议患者的家族成员接受基因检测,明确自身的基因突变携带情况。突变阳性的携带者应该接受相关的干预措施,包括:
(1)改善不良生活习惯
结合《乳腺癌诊治指南与规范(2015版)》(中国抗癌协会)和《中国癌症预防与控制规划纲要(2004~2010)》(中华人民共和国卫生部),建议注意以下几点:
1. 遵循低脂肪、高蛋白、高纤维的饮食原则,多食用富含膳食纤维的粗粮、蔬菜和水果,多食用鱼类和蛋;
2. 培养良好的作息习惯,保证充足的睡眠,不宜熬夜或过劳;
3. 尽量避免吸烟和吸入二手烟,远离烟草对健康的危害;
4. 尽量避免饮酒,远离酒精对健康的危害;
5. 尽量避免接触放射线,远离放射线对健康的危害;
6. 适当锻炼,每周进行不低于5次的有氧运动,每次锻炼时间不少于30分钟;
7. 如需要服用保健品,请参考专业医生的指导意见。
(2)增加体检频率
携带BRCA1和BRCA2基因突变的女性,应比一般人群更早开始乳腺癌的体检筛查,以及增加筛查的频率。
《中国抗癌协会乳腺癌诊治指南与规范(2015)》中提出:推荐一般40~49岁妇女每年进行一次常规体检、乳腺钼靶检查,对致密型乳腺可结合B超检查,50~69岁妇女可每1~2年进行一次上述检查,70岁以上妇女只需每2年进行一次上述检查即可。
对于乳腺癌高危人群建议在40岁之前或者将家属最早的发病年龄提前10年进行筛查。推荐筛查间期为每半年一次,筛查手段除了应用一般人群常用的临床体检、B超、乳房钼靶检查之外,必要时还可做核磁共振等影像学检查。
循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA),是一种存在于血浆或血清、脑脊液等体液中的细胞外DNA,是游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)中的一类,占比约为0.1%-1%,主要来自于坏死或凋亡的肿瘤细胞、肿瘤细胞分泌的外排体及循环肿瘤细胞。 ctDNA片段大小通常为160-180 bp,在血液中半衰期2小时,携带有SNP(点突变)、InDel(插入缺失)、CNV(拷贝数)、fusion(融合基因)等突变信息,在人体血液循环系统中不断流动,可实时反映肿瘤患者当前信息。
BRCA1和BRCA2基因都是抑癌基因,其编码的蛋白通过同源重组(HR)通路参与DNA双链损伤的修复,并且防止可能导致肿瘤生长的异常细胞的分裂。PARP抑制剂可捕获DNA单链断裂处的PARP,阻碍DNA修复。BRCA1/2基因突变的同源重组修复缺陷(HRD)的癌细胞不能有效修复DNA,从而导致细胞死亡,BRCA1/2基因突变阳性者可以从PARP抑制剂治疗中获益,目前已有多款PARP抑制剂在国内外上市,其中奥拉帕利已纳入医保范围。
NGS染色体异常检测报告参考了哪些数据库?
OMIM:/uploads/allimg/211216/130500F02-0.jpg
DECIPHER:/uploads/allimg/211216/1305003913-1.jpg
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DGV:/uploads/allimg/211216/1305002913-3.jpg
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NIPT的检测准确率可以达到99%以上,高于传统唐筛;NIPT在样品采集时无需空腹,而唐筛要求空腹;NIPT可以实现对13/18/21三体的检测,唐筛只能检测18/21三体。
白血病是一类疾病的总称,即造血系统的恶性肿瘤;而贫血则是一种症状的名称,很多疾病可导致贫血,包括白血病也可引起贫血。但多数贫血不发展成白血病(比如缺铁性贫血,地中海贫血,老年性贫血等),但少数有贫血症状的疾病是可以发展成白血病的(比如MDS,骨髓纤维化造成的贫血)。
1) 辅助肿瘤治疗方案选择和疗效评价:检测药物靶点基因,分析基因变异与药物的关系,临床医生可根据肿瘤患者特有的基因变异推荐选择合适的药物;评估药物的疗效和相关毒副作用,实时监控用药治疗效果。
2) 预后评估与复发耐药检测:追踪肿瘤转归、转移和复发,监控肿瘤的演化和适应性改变,实时动态检测药物靶点突变,分析耐药性产生的根源,帮助医生适时调整治疗方案、选择合适的药物。
3) 肿瘤的早期诊断:早发现早治疗,延长患者的生存期。
NGS染色体异常检测与其他临床检测技术有何不同?
导致宝宝畸形或发育异常的原因有很多,染色体数目异常仅为其中一种。无创产前基因检测可以作为其他临床检测项目的一种辅助检查,但不能完全替代产前诊断或其他检查。若孕妇在孕期产检过程中发现其他异常情况,需要听取医生的建议继续做相关检查。
影响IVF成功率的因素有很多,包括女性年龄、不孕的病因、IVF中心技术水平等。
(1)年龄是影响IVF成功率的重要因素,随年龄增长,卵子数量减少,质量下降,受精率下降,妊娠率明显降低,流产率增加;
(2)输卵管积水会显著降低胚胎着床率和妊娠率,使妊娠率下降50%;
(3)子宫异常:如子宫内膜息肉、子宫内膜炎、既往手术或炎症导致子宫内膜损伤,从而影响胚胎着床;
血常规不能作为确诊白血病的手段,但是其对白血病的诊断有一定的辅助作用,因此,日常生活中也需注重血常规检查。
如果一个家族中,有足够的家族史信息提示该家族的成员有可能携带BRCA1和BRCA2基因突变,那么该家族中的乳腺癌患者在知情同意的前提下,可以接受BRCA1和BRCA2基因的检测,以明确自身是否为基因突变的携带者。
如果家族中的乳腺癌患者不能接受BRCA1和BRCA2基因检测,那么家族中的高危个体,最好能够接受基因检测,以明确自已是否为携带者。
该结果还不能作为临床终止妊娠的依据。如果检测结果为高风险或有其他异常提示,请遵循医生建议进行其他产前诊断。
优点:
(1)能帮助部分无法自然受孕的不孕不育患者孕育生命;
(2)能够准确判断受孕时间。
缺点:
(1)试管婴儿的成功率较低,约为25%--35%;
(2)使精子失去了优胜劣汰竞争机会,可能将带微缺失的Y染色体遗传下去,容易造成流产、死胎、先天畸形等缺陷;
(3)如果女性身体不具备孕育条件,比如内分泌紊乱,黄体功能不全,有过流产史等。即使施行试管婴儿手术成功,也可能造成流产;
(4)增加了多胎妊娠风险:多胎妊娠的孕妇并发症多,早产发生率及围生期死亡率高,属高危妊娠范围;
(5)成本高;
(6)对女性生理干扰较大。刺激排卵会导致卵巢反应低下,易出现卵巢功能早衰,40岁以前闭经、卵巢不敏感综合征等。
(1)血常规检查 可检测出患者的红细胞、白细胞和血小板的数量,并对白细胞进行分类,从而确定是否是血液的问题;
(2)骨髓常规检查 骨髓穿刺是确诊白血病的重要检查项目,通过检查可对骨髓中的各类细胞进行记数和分类。如果发现骨髓有异常情况发生,基本可断定是白血病;
(3)免疫分型 该检查也需要抽吸患者的骨髓,再用“单克隆抗体”试剂去识別和划分白血病细胞的类型,以做进一步判断;
(4)细胞遗传学检查 目的是为了解白血病细胞的染色体有无异常。染色体异常也是诱发白血病的重要原因之一。
正常:该样本在全基因组范围内未发现致病性染色体缺失/重复。
染色体非整倍体数目异常:染色体非整倍体数目异常往往伴随着严重的临床表现,相关的临床表现请参考检测报告。
致病CNV:数据库中检索,发现该CNV与某种已知的染色体疾病相关,相关的临床表现请参考检测报告。
CNV多态性:存在CNV变化,一般表现为“良性”,很大可能不表现为患病。
未知CNV:该CNV在数据中检索,未发现相关遗传信息,不能确认其患病与否,后续可抽取父母外周血,确认该“未知”CNV的来源。
无创产前基因检测技术是通过基因检测判断胎儿患染色体非整倍性疾病的风险。检测前孕妇不需要空腹与特殊作息,饮食、感冒、日常用药等情况均不会影响检测结果。
(1)输卵管梗阻的患者;
(2)不明原因不孕的患者,通过IUI等治疗未能妊娠者;
(3)男方重度少弱精,或男方无精症,需经睾丸或附睾穿刺获取精子者;
(4)子宫内膜异位症伴不孕的妇女可以酌情采用IVF助孕;
(5)排卵障碍的患者,经一般的促排卵治疗无成熟卵泡生长。
根据全国肿瘤登记中心发布的《2012中国肿瘤登记年报》中的数据,我国肿瘤发病率为285.91/10万,每年新发肿瘤病例约为312万例,平均每天8550人发病,国内平均每分钟就有6人被诊断为恶性肿瘤,癌症已成为我国居民首要死因,同时国内肿瘤发病还呈现逐年上升和年轻化趋势。
在我国,男性人群中发病率最高的肿瘤是肺癌,其次为胃癌、肝癌、食道癌、结直肠癌等;女性人群中乳腺癌发病率最高,其次为肺癌、胃癌、肝癌、结直肠癌、食道癌、卵巢癌等。
肿瘤的发生主要是由遗传因素和环境因素共同决定的。有家族病史的个体肿瘤患病风险显著增加;携带有肿瘤相关易感基因的个体也会不同程度增加患病风险;长期处在不良环境中或具有不良生活习惯也会造成肿瘤发病率增加,如吸烟、饮食不规律、慢性感染、长期处于污染严重的环境中等。
有肿瘤家族史的人患肿瘤几率比普通人高,但到目前为止,针对白血病而言,还没有垂直遗传情况,一般来说,白血病不具有明显的遗传性。
1、全部23对染色体的数目异常;
2、0.1M以上染色体缺失/重复以及大于10%的非整倍体嵌合;
3、不能检测染色体平衡易位、罗氏易位、倒位,单基因病、多基因病,以及D/G组染色体短臂等。
1)绒毛取样术(在10-13+6周进行),1-2%流产率;
2)羊水穿刺术(在16-22+6周进行),0.5-1%流产率;
3)脐血穿刺术(大于28周以后进行),1-2%流产率。
常规肿瘤预防分为三级。一级预防为病因预防,即通过积极避免和消除各种致病因素提高个体防癌能力;二级预防又称为临床前预防,即早发现、早诊断、早治疗,;三级预防即康复预防,指在肿瘤诊断后,通过各种临床措施防治病情恶化并尽可能达到治愈。
一、二级预防的具体措施包括通过远离各种环境致癌风险因素,消除肿瘤发病相关的感染因素、改变不良生活方式、进行适当的运动、保持精神愉快以及有针对性地参加体检,对极高危人群或者癌前病变采用一定的医疗干预手段来降低肿瘤发病风险。
世界卫生组织(WHO)指出:早期发现是提高癌症治疗率的关键。只要早期发现,90%的癌症完全可以治愈,死亡率可减少约三分之一。因此早期发现潜在肿瘤发病风险对于肿瘤的预防意义重大。
目前新一代基因测序技术的应用进一步促进了肿瘤的早期预防,通过对人体细胞内的遗传物质进行分析,从源头上充分评估受检者罹患肿瘤的风险,再针对个体情况配合相应健康管理,从而有效实现肿瘤的早期预防。
急性淋巴细胞白血病(ALL)包括成人ALL和儿童ALL两类,其发病年龄呈双相分布,80%的儿童发生在2-5岁之间;成人在50岁左右呈峰值。
正常孕妇游离DNA主要来源于造血干细胞的凋亡,而肥胖孕妇由于脂肪组织及基质血管细胞凋亡,增加了血浆中母亲游离DNA的含量;另外,肥胖孕妇因较大的血液循环体系稀释了血浆中的胎儿游离DNA的浓度,造成胎儿浓度不足从而会降低检测的准确性。
(1)准备好结婚证、夫妻二人的身份证以及准生证;
(2)合理饮食,适当运动;
(3)停止吸烟;
(4)患者要谨慎服药,相关细节可咨询主治医生。
DNA(Deoxyribonucleic acid),即脱氧核糖核酸,是染色体的主要化学成分,同时还是生物体遗传信息的最基本载体。
基因是DNA分子上具有遗传效应的片段。基因不仅可以通过复制把遗传信息传递给下一代,还可以使遗传信息得到表达。基因控制着人类生命活动,与人类的“生、老、病、死”息息相关;它决定了人类的相貌、肤色、体质、疾病易感性及药物敏感性等,被誉为人类的“生命之书”。
染色体数目及结构异常在ALL患者中十分常见,几乎半数以上的ALL伴有染色体数目的异常,而同时伴有结构异常者更为常见,约占到此类病例的40-70%。
基因功能
PAH基因是编码生物蝶呤依赖性芳香族氨基酸羟化酶蛋白家族的成员,编码的苯丙氨酸羟化酶是苯丙氨酸分解代谢的限速酶,可将苯丙氨酸羟化为酪氨酸。
苯丙氨酸是人体必需氨基酸之一,三分之一供机体合成组织蛋白,三分之二转化为酪氨酸,用于合成甲状腺素、多巴胺、肾上腺素、黑色素。
相关疾病
PAH基因突变会引起苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)(OMIM:261600),收录在《第一批罕见病目录》。
致病机制
PAH基因突变→苯丙氨酸代谢障碍→苯丙氨酸积聚/酪氨酸减少→高苯丙氨酸表现。
核心表型
PKU是一种常见的氨基酸代谢病,主要临床特征:智力低下、精神神经症状、小头畸形、毛色发黄、湿疹、皮肤抓痕征、以及尿液和全身鼠臭味等。患儿一旦确诊,需终生采用低苯丙氨酸饮食,禁食如小麦、蛋类、肉、鱼、虾、乳类等含丰富的苯丙氨酸食物的摄入等食物,这些食物都是日常食用的食物,因此苯丙酮尿症患者素有“不食人间烟火的孩子”之称。
遗传方式
本病的遗传方式为常染色体隐性遗传。
发病率
我国PKU的发病率约1/11144,携带率约1/35。
治疗方案
苯丙酮尿症患者根据相应年龄段儿童每日蛋白质需要量、血苯丙氨酸浓度和耐受量、饮食嗜好等调整制定治疗方案。
虽然双胎及多胎妊娠总体血浆cffDNA含量上升,但2个胎儿贡献到母体的浓度是不一致的,若其中一个胎儿的cffDNA含量低于4%,会存在假阴性风险。如果双胎中有一胎停育,残留在母体的cffDNA会干扰检测,影响NIPT检测准确性。
一般试管婴儿费用包括三个方面,术前检查费用、手术费用以及术后检查费用,不同医院的试管婴儿费用是不同的。
急性髓系白血病(AML)也是成人和儿童中高发的白血病之一。约55-78%成人AML患者及79-85%的儿童AML患者伴有染色体异常;55%的AML病例只以单独异常出现,其余伴有另外的异常;与ALL染色体异常不同,AML相关染色体异常以结构变异为主,高达39种。
致病基因
该病的致病基因PTS基因(NM_000317.2)定位于11号染色体(11q23.1),由6个外显子组成。
基因功能
苯丙氨酸是人体必需氨基酸之一,可通过苯丙氨酸羟化酶进行苯丙氨酸的分解代谢,在此羟化过程需要辅酶四氢生物蝶呤的参与,它的转化和再生过程中参与的酶有四个,该类酶可催化NADH介导的醌二氢生物蝶呤还原,是蝶呤依赖性芳香族氨基酸羟化系统的重要组成部分,在酶促反应中作为电子载体起还原剂的作用。其氧化型为二氢生物蝶呤,后者在二氢生物蝶呤还原酶催化下以NADPH为供氢体还原再生成为四氢生物蝶呤。四氢生物蝶呤不足或催化四氢生物蝶呤再生的还原酶缺陷,是苯丙氨酸羟化反应受阻的主要原因。
相关疾病
与代谢苯丙氨酸有关的疾病除经典的苯丙氨酸外,还有PTS基因突变所致四氢生物蝶呤缺乏性高苯丙氨酸血症A型(OMIM:261640),GCH1基因突变所致四氢生物蝶呤缺乏性高苯丙氨酸血症B型(OMIM:233910),QDPR基因突变所致四氢生物蝶呤缺乏性高苯丙氨酸血症C型(OMIM:261630),PCBD1基因突变所致四氢生物蝶呤缺乏性高苯丙氨酸血症D型(OMIM:264070),这四种亚型也被称为是:异型苯丙酮尿症,以上疾病均收录在《第一批罕见病目录》。
致病机制
PTS等辅酶基因突变→苯丙氨酸羟化反应受阻→苯丙氨酸积聚/酪氨酸减少→高苯丙氨酸表现。
核心表型
BH4缺乏型患儿的神经系统症状出现比经典的苯丙酮尿症更早且较严重,常见肌张力减低,嗜睡和惊厥,智能落后明显;患儿在出生数月后毛发、皮肤和虹膜色泽变浅;婴儿期常有呕吐、皮疹等表现,年长后消失;患儿尿液和汗液同样有鼠尿臭味。
遗传方式
本病的遗传方式均为常染色体隐性遗传。
发病率
BH4缺乏型患儿的发病率和正常人群携带率同经典苯丙酮尿症。
治疗方案
非经典型苯丙酮尿症患儿应依据酶缺乏情况予以不同治疗,但不需辅以低苯丙氨酸饮食。即使早期采用低苯丙氨酸饮食,神经系统仍损害严重,非经典型苯丙酮尿症如不经治疗,常在幼儿期死亡。
近年来,分子检测技术常用于白血病的分型及预后评估,常用的分子检测手段主要包括:RP-PCR、荧光原位杂交(FISH)、光谱核型分析技术(SKY)、比较基因组杂交技术(CGH)、及新一代高通量测序技术。
孕周<12周;夫妇一方有明确染色体异常;1年内接受过异体输血、移植手术、异体细胞治疗等;胎儿超声检查提示有结构异常须进行产前诊断;有基因遗传病家族史或提示胎儿罹患基因病高风险;孕期合并恶性肿瘤;医师认为有明显影响结果准确性的其他情形。
融合基因是引发白血病的重要因素之一,目前,已证明有90多种融合基因和白血病相关,对白血病融合基因进行检测,可为白血病诊断、分型、临床治疗选择和预后判断提供重要依据。
甲基丙二酸血症/尿症是一种常见的有机酸代谢病,患者多起病早,多在出生后一周内发病。神经系统症状为主:常见嗜睡、生长发育不良、反复发作性呕吐、脱水、呼吸窘迫和肌张力低下。50%有白细胞减少、血小板减少和贫血。部分病例有低血糖症。临床检验:血清钴胺素(VB12)浓度正常,有代谢性酸中毒,80%有酮血或酮尿症,70%有高氨血症。
遗传方式
本病的遗传方式为常染色体隐性遗传。
发病率
发病率约1/30,000-50,000,正常人群携带率约1/90。该病以Cb1C型和MUT型最为常见。
致病基因
甲基丙二酸血症相关的基因:
MUT型的致病基因MUT基因(NM_000255.3)定位于3号染色体,由14个外显子组成;
MMAA基因定位于4号染色体(4q31.21),由8个外显子组成;
MMAB基因定位于12号染色体(12q24.11),由13个外显子组成;
MMACHC基因定位于1号染色体(1p34.1),由4个外显子组成;
MMADHC基因定位于2号染色体(2q23.2),由8个外显子组成;
LMBRD1基因定位于6号染色体(6q13),由13个外显子组成。
基因功能
甲基丙二酸是一种有机酸,丙酸、胸腺嘧啶等代谢过程产生的甲基丙二酰CoA,分解生成甲基丙二酰辅酶A,直至生成甲基丙二酸。甲基丙二酸是甲基丙二酰辅酶A的代谢产物,正常情况下在甲基丙二酰甲基钴胺辅酶A变位酶及维生素B12的作用下转化生成琥珀酸,参与三羧酸循环。
甲基丙二酰辅酶A变位酶缺陷或维生素B12代谢障碍导致甲基丙二酸、丙酸、甲基枸橼酸等代谢物异常蓄积,琥珀酸脱氢酶活性下降,线粒体能量合成障碍,引起神经、肝脏、肾脏、骨髓等多脏器损伤。
相关疾病
甲基丙二酸血症相关亚型有:
MMAA基因突变会引起甲基丙二酸尿症Cbla型(OMIM:251100);
MMAB基因突变会引起甲基丙二酸尿症Cblb型(OMIM:251110);
MMACHC基因突变会引起甲基丙二酸尿症伴同型半胱氨酸血症CblC型(OMIM:277400);
MMADHC基因突变会引起甲基丙二酸尿症伴同型半胱氨酸血症CblD型(OMIM:277410);
LMBRD1基因突变会引起甲基丙二酸尿症伴同型半胱氨酸血症CblF型(OMIM:277380);
MUT基因突变会引起甲基丙二酸尿症Mut型(OMIM:251000);
以上疾病均收录在《第一批罕见病目录》。
致病机制
MUT等基因突变→钴胺素代谢缺陷→腺苷钴胺素和甲基钴胺素合成不足→甲硫氨酸合成酶和甲基丙二酰辅酶A变位酶活性减低→甲基丙二酸及同型半胱氨酸蓄积→神经、心血管、肝脏、肾脏和皮肤等多系统损伤。
治疗方案
1. 急性期治疗应以补液、纠正酸中毒及电解质紊乱为主,同时应限制蛋白质摄入,供给充足的热量,避免静滴氨基酸。
2. 长期治疗:
① 饮食治疗:维生素B12无效或部分有效的单纯型MMA患者以饮食治疗为主,控制蛋白质总摄入量,其余蛋白通过给予不含异亮氨酸、缬氨酸、苏氨酸和蛋氨酸的特殊配方营养粉或蛋白粉补充;
② 药物治疗:维生素B12、左旋肉碱、甜菜碱、叶酸;
③ 康复训练。
接收样本后10个工作日即可出具报告。
(1)男方能够提供健康精子;
(2)女方身体健康且能妊娠;
(3)女方卵巢有正常健康的卵子;
(4)女方子宫腔正常,适合受精卵着床、胚胎发育。
肿瘤的基因检测与常规体检所反映的阶段不同。基因检测是人体还未发病时,从遗传层面上分析患病风险;而常规检测是检查肿瘤是否发生及目前的发生程度。因此,肿瘤基因检测是主动性的预防疾病的发生,而传统的体检手段则无法达到这样的预防作用。
所谓"预后"是指对疾病结局的预先估计。通常以治愈率、复发率、缓解率、病残率、病死率和生存率等概率指标表示。白血病的预后是指通过已掌握的白血病的转归与结局的发生概率及相应的影响因素,对某一白血病患者疾病结果的预先估计。
本病通常发生于儿童和青少年期。肝脏异常:肝硬化、肝脾肿大;神经精神症状:神经症状以舞蹈样动作、手足徐动和肌张力障碍为主;精神症状:注意力和记忆力减退、智能障碍、反应迟钝、情绪不稳(常伴有强笑、傻笑、冲动、人格改变);眼部表现:特征性铜离子沉积的角膜色素环(K-F环)。
遗传方式
本病的遗传方式为常染色体隐性遗传。
发病率
本病发病率约1/30,000,携带率约1/90。
致病基因
肝豆状核变性致病基因ATP7B (NM_000053.3)定位于13号染色体(13q14.3),由29个外显子组成。
基因功能
ATP7B基因是铜转运P型ATP酶家族的成员,编码具有几个跨膜结构域,一个ATPase共有序列,一个铰链结构域,一个磷酸化位点和至少两个铜结合位点的蛋白质。
ATP7B基因突变导致ATP酶功能减弱或消失,引致血清铜蓝蛋白(ceruloplasmin,CP)合成减少以及胆道排铜障碍。
相关疾病
ATP7B基因突变会引起肝豆状核变性(OMIM:277900),为《第一批罕见病目录》收录疾病。由Wilson在1912年首先描述,故又称为Wilson病(Wilson Disease,WD)。
致病机制
ATP7B基因突变→金属铜离子排出障碍→体内的铜离子在肝、脑、肾、角膜等处沉积→相应临床表现。
治疗方案
1. 饮食治疗:避免高铜的食物,勿用铜质食具及用具;
2. 药物驱铜治疗:主要有两大类药物,一是络合剂(如青霉胺、二巯丙磺酸钠、三乙烯-羟化四甲胺、二巯丁二酸等),二是阻止肠道对外源性铜的吸收(如锌剂、四硫钼酸盐);
3. 药物对症治疗:有震颤和肌强直时可用本海索口服,对粗大震颤者首选氯硝西泮。肌张力障碍可用本海索、复方左旋多巴制剂、多巴胺受体激动剂,局限性肌张力障碍可服用氯硝西泮、硝西泮、巴氯芬。有舞蹈样动作和手足徐动症时,可选用氯硝西泮、硝西泮、氟哌啶醇,合用本海索。对于精神症状明显者可服用抗精神病药奋乃静、利培酮、氟哌啶醇、氯氮平,抑郁患者可用抗抑郁药物、护肝治疗药物也应长期应用;
4. 手术治疗:对于有严重脾功能亢进者可行脾切除术,严重肝功能障碍时也可以考虑肝移植治疗。
胎儿浓度小于4%,容易造成假阴性;胎儿浓度随孕周的增加而增加,有报道称12孕周前,约5%的孕妇胎儿游离DNA含量(cffDNA)低于4%,NIPT检测存在假阴性风险。
融合基因与疾病的预后关系密切,对于指导临床个性化治疗方案的选择和判断预后具有十分重要的意义。急性白血病:PML/RARA,CBFB/MYH11,AML1/ETO融合基因预后较好,化疗完全,缓解率高,可长期缓解或治愈;而对于有MLL异常、MYC/IgH融合基因的AML,BCR/ABL融合基因的ALL对化疗反应差,复发率高,有了融合基因的检测,初治时可进行指导,并选择科学合理的长期治疗方案,避免不必要的治疗或过度治疗。
X连锁隐性遗传病也是一类导致出生缺陷的重要遗传性疾病,女性携带者常常没有疾病表型,但是生育男性后代的发病风险为50%,生育女性携带者的风险为50%。这类疾病中的典型代表有:假肥大型肌营养不良(DMD)、血友病(甲型和乙型)。
图:X连锁隐性遗传病的遗传模式图(女性携带者生育男性后代的患病风险为1/2)
耳聋是临床上常见的遗传病之一,而遗传性耳聋不但影响患儿自身,还会通过遗传影响后代,在后代中以一定数量出现。那么,耳聋有哪些遗传方式,又有哪些基因可致耳聋呢?下面就和小编一起看看“无声的世界”背后的故事吧~
核心表型
三种功能基因突变引起的耳聋约占整个遗传性耳聋的80%。亚洲人群中,GJB2的235delC突变约占80%以上。
GJB2基因引起的耳聋听力表现为:大部分表现为双耳先天性重度、极重度感音神经性耳聋,少部分表现为轻、中度耳聋、儿童迟发型耳聋。
SLC26A4基因引起的耳聋特点为:双耳先天性或后天性进行性重度、极重度感音性耳聋(伴有内耳畸形);另外也是Pendred综合征(OMIM:274600)的致病基因,Pendred综合征也称为耳聋-甲状腺综合征,此型患者常有甲状腺肿大。该基因突变的患者耳聋发生常有外伤、感冒等诱发因素,因此又被称为外力可造成的“一巴掌耳聋”。
mtDNA引起的氨基糖苷类抗生素药物性耳聋,线粒体DNA突变为母系遗传,耳聋特点为:双侧、对称性高频听力下降的感音性耳聋,常被称为“一针耳聋”。
遗传方式
1)GJB2基因引起的非综合征型耳聋的遗传方式有常染色体显性、常染色体隐性遗传两种遗传方式;
2)SLC26A4相应的疾病为常染色体隐性遗传;
3)mtDNA耳聋为母系遗传。
发病率
中国先天性耳聋患者中携带有GJB2 基因突变的约占20%,正常人携带率为2-3%。
我国96%的前庭导水管扩大患者有SLC26A4基因突变,中国耳聋人群SLC26A4基因突变检出率为20.35%,正常人携带率为2%。
mtDNA突变引起的耳聋在人群的携带率约为0.4%,我国耳聋患者中药物致聋占30-40%。
致病基因
基因功能
GJB2基因编码缝隙连接蛋白β2,缝隙连接蛋白是构成细胞间缝隙连接通道的基本结构和功能的一大类膜蛋白。GJB2基因编码的Cx26与相邻细胞的缝隙连接蛋白组成一个完整的缝隙连接通道,该通道在信号传导和物质交换时起着重要作用,是电解质(尤其是钾离子)、第二信使和代谢产物在细胞间转换的重要通道,钾离子在内耳毛细胞和耳蜗内淋巴液的循环受上述缝隙连接蛋白通道调控。
相关疾病
GJB2 基因是第一个被克隆和鉴定的遗传性耳聋致病基因, 也是导致非综合征遗传性耳聋最常见的基因, 其突变所致的遗传性耳聋占散发患者的 30-40%。以常染色体隐性遗传(OMIM:220290)为主,也有常染色体显性遗传方式(OMIM:601544),SLC26A4基因,是常染色体隐性遗传耳聋4型伴前庭导水管扩大症(OMIM:600791)的致病基因,收录在《第一批罕见病目录》。
致病机制
GJB2 基因突变→缝隙连接通道功能缺陷→内耳毛细胞和耳蜗内淋巴液的循环受阻→感音神经性耳聋。
治疗方案
1. 助听器;
2. 人工耳蜗植入。
合并性肿瘤的孕妇,可能出现多条染色体异常,如果肿瘤本身含有T21、T18或T13的异常细胞,细胞凋亡后释放异常的基因组DNA进入母体血浆中,可能导致NIPT出现假阳性的情况。
(1)夫妇双方的染色体核型检查;
(2)行宫腔镜检查,除外宫腔异常,如存在子宫内膜息肉;内膜活检,检查有无子宫内膜炎(病理);
(3)宫内膜血流测定;
(4)输卵管积水检查;
(5)对于某些患者,胚胎辅助孵化有可能增加胚胎着床的机会。
AG真人官网优达肿瘤基因检测针对全球范围内高发的42种肿瘤 ,共涉及上百种相关基因。主要包括:乳腺癌、卵巢癌、肺癌、结直肠癌、胃癌、前列腺癌、鼻咽癌、膀胱癌等。AG真人官网优达采用新一代高通量测序技术开展检测,该技术准确率达99%以上。
(1)为明确眼底有无白血病细胞浸润;
(2)为明确有无合并眼底出血,因为眼底出血常被视为颅内出血的先兆;
(3)当患者因出现头痛、呕吐等症状被怀疑有颅内出血或脑白时,检查眼底有助于通过视乳头的变化以明确患者是否合并颅内压升高,后者常为危及生命的紧急状况,需及时予以脱水降颅压等积极治疗。
常染色体显性遗传病,携带致病基因的个体,一般都有疾病表型,但是也有一些携带致病突变基因但不发病的情况,也可以称之为携带者,如:外显不全、迟发型疾病。这种情况的携带者,生育后代发病风险较高,甚至有些迟发型疾病的后代疾病表型会出现的更早、更重,如亨廷顿舞蹈症。
图:常染色体显性遗传病遗传模式图(患者的生育风险为1/2)
按照末次月经算,B超的大小可能和实际孕周有偏差。
(1)微阵列技术,也称作基因芯片技术,是以微点样技术将大量已知序列的DNA探针在固体支持物上排列成高密度的探针矩阵,计算机扫描收集分子杂交信息,通过生物信息学分析,获得所需信息,具有高效率、低消耗、大通量、高精度以及能平衡对照研究等特点;
(2)高通量测序技术,又称深度测序技术或下一代测序技术,是以大规模并行测序为特征,可一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,具有低成本、高通量、高覆盖度等特点。
AG真人官网优达肿瘤基因检测报告主要包括以下内容:
检测结果:检测范围内相关基因的变异信息;
(1)报告解读:对检测到的基因变异信息进行解释和说明(这些变异的临床意义及参考依据);
(2)生活建议:以检测结果为基础,综合受检者个人健康信息,提供个性化的生活方式建议及健康管理方案。
白血病耐药是指白血病细胞对所用化疗药物不敏感或具有抵抗性。某一患者虽经几个疗程的联合化疗,骨髓内的白血病细胞百分比无明显下降,或是一时减少,但在短期休疗后很快又增长至化疗前水平,这种情况即可视为白血病耐药。白血病细胞产生耐药性是目前白血病治疗失败的主要原因之一。
常染色体隐性遗传病携带者是最为常见的携带者,如果去检测每一个人的全基因组信息,会发现每一个人都是携带者,但是大多为罕见的常染色体隐性遗传病的基因突变,生育患儿的风险并不高。因为只要配偶不携带相同基因的缺陷,生育患儿的风险就极低。但是,如果其配偶也为同一致病基因的携带者,这种情况多发生在常见的常染色体隐性遗传病(如我国南方地区的地中海贫血)上,那么后代患病的风险就增加为25%。近亲婚配时,夫妻双方获得相同致病基因缺陷的机会大大增加,生育常染色体隐性遗传病的风险就会升高,这也是我国法律明确禁止三代以内近亲婚配的原因之一。
图:常染色体显性遗传病遗传模式图(患者的生育风险为1/2)
AG真人官网优达肿瘤基因检测服务在实验室收到样本后,7-10个自然日即可出具报告。AG真人官网优达项目管理人员将通过邮件或微信等形式电子版反馈受检者。纸质版报告可根据受检者具体要求寄送给受检者本人及家属或样本的送检医院。
一般来讲,骨髓穿刺对人体健康并无影响。但骨穿实则属于创伤性检查之一,加之目前我国所用骨穿针均非一次性耗用品,因此,极少数情况下可能在操作过程中发生穿刺意外情况。
检测结果提示有风险意味着受检者本人的相关肿瘤患病风险与正常人群相比会有不同程度的增加,但并不意味着受检者一定会患病。肿瘤疾病的发生是遗传因素和环境因素共同作用的结果,携带有肿瘤易感基因的个体可以通过避免肿瘤相关诱因、健康的生活方式和相应的医疗预防措施来降低患病风险,避免肿瘤的发生。具体的应对措施请参考检测报告并咨询送检医生。
另外,检测结果提示有风险,建议受检者的直系亲属也参加检测。
目前对白血病的治疗是以细胞毒药物联合化疗为主的综合性治疗。
细胞毒药物在极大程度杀伤白血病细胞的同时,也对体内所有增殖力旺盛的细胞,如性腺细胞、粘膜上皮细胞等具有相当程度的杀伤作用或致畸作用。尤其当白血病患者合并有睾丸或卵巢等处白血病浸润时,为治疗这些髓外白血病病灶,尚需在全身化疗的同时辅以必要的局部放射性治疗。这些措施无疑会使正常的生殖细胞与白血病细胞“同归于尽”。
因此,经上述治疗后的白血病患者生育力将受到极大影响,婚后不育,或一旦怀孕,胎儿的畸形、致残或死亡、流产发生率均极高。
可以向送检医师咨询,或是拨打AG真人官网优达热线:4008-986-989,AG真人官网优达的遗传咨询团队将提供遗传解读服务。
骨髓移植是指将供者的骨髓造血干细胞移植给受体(患者),以恢复后者正常造血功能的一种治疗手段。骨髓移植根据其骨髓来源的不同,可分为同种异基因骨髓移植(HLA相合的同胞或非亲属骨髓)、同基因骨髓移植(遗传上完全相同的单卵孪生子骨髓)及自体骨髓移植等三种。
各位孕妈妈在产检时常会听到的唐氏筛查,是一项有着30多年历史的技术,可以帮助临床医生判断肚子里胎儿出现唐氏综合征的风险,同时这种便捷、快速、廉价的筛查方法,更是对孕妇增加了一层保护,大大提升唐氏儿的检出率。
但是,唐氏筛查只能帮助判断胎儿患有唐氏综合征的几率大小,并不能明确胎儿是否为患儿。结果显示高风险时,怀有唐氏儿的机会较高;显示低风险时,也不能保证胎儿绝对不是唐氏儿。而无创产前DNA检测,可以显著提高唐筛检测准确率,达到99.9%以上。
而在茫茫的产检单中,还有一个名字和唐筛极其相似,让无数孕妈困扰不已。妊娠期糖尿病筛查,简称糖筛,通过服用大量糖水来验证孕妈是否有糖代谢异常,以发现潜在的妊娠糖尿病,避免胚胎发育异常、流产、妊娠高血压、感染等并发症。
以上介绍的是孕期最常见的检查,采用两种完全不同的技术,但均属必须要做的检查。有些准妈妈会存疑,我的家庭中没有唐氏综合征患者,为何需要做唐筛?这是因为唐氏综合征虽然是一种遗传性疾病,但每一对健康夫妇都有怀上唐氏儿的可能,且概率随着孕妇年龄增大而提高,而唐氏儿不仅会多发畸形,还会伴有严重的智力异常。所以为了预防这样的孩子出生,2018年国家卫健委颁布的规范要求各地妇幼保健单位均要提高产前筛查率,减少出生缺陷发生。对于糖筛也是一样,没有糖尿病家族史的女性,也可能存在糖耐受性低的状况。而妊娠可使隐性糖尿病显性化,使既往无糖尿病的孕妇发生妊娠期糖尿病,使原有糖尿病患者的病情加重,从而引起一系列问题。所以各位孕妈妈一定要区分好两种检查,不要因为名字相似就放弃其中任何一个。
男性不育症
对1958-2018年Pubmed内所有出版物进行系统的文献检索和证据评估后发现,在总共23,526条记录里,排除与遗传因素不相关文献,入选paper共1,337篇,其中男性不育和/或泌尿生殖系统发育不良相关疾病涵盖约521个基因[1]。据文献报道,遗传因素造成男性不育症的约占15%,克氏综合征(先天性睾丸发育不全)最常见,男性Y染色体异常或常染色体基因突变引起的无精症、少精症、弱精症、畸形精子症等生精障碍疾病也都是引起男性不育的常见遗传病因[2],无精症里尤以非阻塞性无精子症(NOA)值得注意,研究证实,一些基因和拷贝数变异与NOA有关[3];另外男性内分泌激素异常的Kallmann综合征[4]、性发育异常疾病(Disorders of Sex Development,DSD )[5]也都会引起男性不育。
男性不育症遗传病因汇总示意图[1]
女性不孕症
女性不孕症中约有30%为特发性不孕(病因未明),其中约50%女性由于生殖系统缺陷或发育异常导致不孕,在女性生殖系统中遗传因素多见于卵巢异常,如:卵泡发育过程中细胞因子异常或促性腺成熟激素调控通路涉及的基因异常等原因导致的卵巢早衰、卵巢发育不全、卵母细胞成熟缺陷等问题均会引起女性不孕[6]。
原发性卵巢功能不全相关基因染色体位置示意图[6]
其次约7–10%的女性不孕是子宫或阴道异常所致,其中,缪勒管发育异常最为严重,也称为Mayer-RokitanskyKüster-Hauser(MRKH)综合征,患者先天性缺乏子宫和阴道(I型,OMIM#277000),或伴有肾发育不全,骨骼异常,心脏异常或耳聋(II型,OMIM#601076),1/4500–1/5000的女性受MRKH综合征的影响,约占原发性闭经总数的10%,因此当育龄女性出现月经不规则或不明原因的闭经应予以重视[7]。
反复流产
连续发生≥2次的自然流产定义为复发性流产,经典的理论将连续发生≥3次的自然流产定义为习惯性流产。反复流产的病因归结主要有以下因素:胚胎父母染色体异常(2–5%)、子宫异常(10–15%)、感染(0.5–5%)、内分泌因素(17–20%)、自身免疫性疾病(20%),以及50%病因未明(在病因未明的流产因素通常也有和遗传因素有高度相关性的致病因素)[8]。
反复流产病因学归类示意图[8]
男性Y染色体微缺失、女性X染色体选择性失活,生成的配体会出现染色体不分离这种遗传变异的可能性,增加减数分裂错误的风险,形成非整倍体配子,进而形成非整倍体胚胎导致流产,故胚胎自身染色体异常是直接表现,流产比例高达30-78%,而根源就是父母染色体存在异常[8]。
女性自身基因变异也占较高流产比例。凡导致凝血活性增强或抗凝作用减弱的因素都可导致血栓形成,造成流产,血栓的发生有遗传因素也有免疫因素,故反复流产存在“遗传-免疫-凝血-炎症”一体化学说[8],在此任一通路上的基因出现异常,均可导致流产发生。
以上就是引起不孕不育常见的三种临床表型,有上述情况的夫妻,遗传病因应引起警惕,通过必要的生殖生育咨询或遗传咨询,结合分子检测技术和遗传数据解读,进行诊疗,以期早发现、早治疗、早预防。
参考文献:
1、什么是产前诊断?
产前诊断是指利用医学遗传学、分子生物学、影像学等技术对胎儿进行先天缺陷和遗传性疾病的诊断,使父母获得知情选择权或宫内治疗的机会。
2、哪些人需要做产前诊断?
1)年龄≥35岁的高龄孕妇;
2)产前筛查高风险:唐氏筛查高风险、NIPT检测高风险;
3)孕期不良用药史:妊娠早期接触过可能导致胎儿先天缺陷的物质;
4)孕期接触放射线:CT/其他放射物品;
5)不良孕产史:死胎/新生儿死亡/婴儿夭折/既往妊娠(或分娩)异常胎儿;
6)夫妇之一有先天性疾病或者遗传性疾病;
7)有遗传病家族史或夫妇近亲婚配。
3、产检、产筛和产诊有何区别?
产前检查:每位孕妇进行的常规孕期检查;
产前筛查:针对所有孕妇,筛查出高风险胎儿及孕妇;
产前诊断:针对筛查风险是高风险或有不良孕产史/家族史的孕妇,目的是确诊。
4、介入性产前诊断手术
绒毛取材术(10-13+6周)
羊膜腔穿刺术(16-22+6周)
脐静脉穿刺术(28周之后)